Le choix de la densité bâtie a permis de libérer, au sein du campus, près de 180 ha pour la constitution d’un paysage composite situé le long des espaces agricoles et naturels protégés du plateau. Coté Quartier de l’Ecole polytechnique, cette épaisse lisière s’enrichit jusqu’à devenir un parc naturaliste de 90 ha, le lieu où se rejoue la réconciliation de deux mondes que l’on a longtemps opposé : la ville et la campagne. La combinaison de l’écologie et de l’ingénierie est essentielle à la constitution de ce paysage intermédiaire. De grands bassins liés au fonctionnement du quartier sont rassemblés en une succession de pièces d’eau, complétant le lac actuel et intégrant des habitats pour la faune et la flore. Certaines berges sensibles et certains boisements dédiés aux espèces protégées restent inaccessibles. Des clairières accueillent terrains de sport et autres espaces dédiés aux usagers pour, reliés au Campus par de nouveaux cheminements piétons-cycles. Le parc naturaliste accueille à la fois des services écologiques mutualisés et des lieux de pratiques, d’activités et d’échanges.